Architektura klonalna wtórnej ostrej białaczki szpikowej

 

width=980

Zespoły mielodysplastyczne stanowią grupę zaburzeń hematologicznych, które często przekształcają się w wtórną ostrą białaczkę szpikową (AML). Zmiany genetyczne, które leżą u podstaw progresji od zespołów mielodysplastycznych do wtórnych AML, nie są dobrze poznane. Metody
Przeprowadziliśmy sekwencjonowanie całego genomu siedmiu sparowanych próbek skóry i szpiku kostnego u siedmiu pacjentów z wtórną AML, aby zidentyfikować mutacje somatyczne właściwe dla wtórnej AML. Następnie genotypowaliśmy próbkę szpiku kostnego uzyskaną podczas poprzedzającego stadium zespołu mielodysplastycznego od każdego osobnika w celu określenia obecności lub braku określonych mutacji somatycznych. Zidentyfikowaliśmy powtarzające się mutacje w genach kodujących i zdefiniowaliśmy architekturę klonalną każdej pary próbek z etapu mielodysplastycznego zespołu i stadium wtórnej AML, stosując obciążenie alleli setek mutacji.
Wyniki
Około 85% komórek szpiku kostnego było klonalnych w zespole mielodysplastycznym i drugorzędowych AML, niezależnie od liczby mieloblastów. Próbki wtórnej AML zawierały mutacje w 11 zmutowanych genach, w tym 4, które nie były wcześniej związane z zespołami mielodysplastycznymi lub AML. W każdym przypadku progresja do ostrej białaczki była określona przez utrzymywanie się wcześniejszego klonu założycielskiego zawierającego 182 do 660 mutacji somatycznych i pojawienie się co najmniej jednego subklonu, niosącego dziesiątki do setek nowych mutacji. Wszystkie klony i subklony tworzące zawierały co najmniej jedną mutację w genie kodującym.
Wnioski
Prawie wszystkie komórki szpiku kostnego u pacjentów z zespołami mielodysplastycznymi i wtórną AML są pochodzenia klonalnego. Ewolucja genetyczna wtórnej AML jest procesem dynamicznym ukształtowanym przez liczne cykle akwizycji mutacji i selekcji klonów. Nawracające mutacje genów można znaleźć zarówno w klonach założycielskich, jak i subklonach potomnych. (Finansowane przez National Institutes of Health i inne.)
Wprowadzenie
Zespoły mielodysplastyczne, heterogenna grupa chorób charakteryzujących się nieskuteczną hematopoezą, są najczęstszą przyczyną nabytej niewydolności szpiku kostnego u osób dorosłych.1 Wtórna ostra białaczka szpikowa (AML) rozwija się u około jednej trzeciej osób z zespołami mielodysplastycznymi.2 Dyskryminacja kliniczna między zespoły mielodysplastyczne i wtórna AML obecnie opierają się głównie na analizie cytomorfologicznej, ponieważ pacjenci z zespołami mielodysplastycznymi mają hematopoezę dysplastyczną i liczbę mieloblastów mniejszą niż 20%, podczas gdy u pacjentów z liczbą mieloblastów wynoszącą 20% lub więcej występuje AML. Pomimo znacznego nakładania się spektrum zmian cytogenetycznych i molekularnych obserwowanych w tych dwóch zaburzeniach, wśród pacjentów, ubezpieczycieli i agencji finansujących pozostaje niepewność co do tego, czy zespoły mielodysplastyczne są faktycznie nowotworami.3
Wydarzenia genetyczne leżące u podstaw postępu od dysplazji komórkowej do raka były szeroko badane w tkankach nabłonkowych (np. Z okrężnicy i ustnej części gardła), 4-6, ale mniej wiadomo o progresji genetycznej zespołów mielodysplastycznych do wtórnej AML. Rektyfikacja genu-kandydata zidentyfikowała kilka genów, które mają nawracające mutacje podczas ewolucji od zespołów mielodysplastycznych do wtórnych AML (np. FLT3, NPM1, RUNX1, TP53 i NRAS), 7-15, ale nasze zrozumienie całkowitej liczby i dystrybucji klonalnej mutacji w tej chorobie jest ograniczona. Wykorzystaliśmy sekwencjonowanie całego genomu do odkrycia mutacji somatycznych w próbkach szpiku kostnego uzyskanych od siedmiu osobników z wtórną AML i ustaliliśmy, czy mutacje te były obecne w parach próbek uzyskanych podczas poprzedzającego zespołu mielodysplastycznego. Wykorzystaliśmy tę informację do określenia proporcji komórek klonalnych i architektury genetycznej w momencie diagnozy zespołu mielodysplastycznego i progresji do wtórnej AML.
Metody
Metody są szczegółowo opisane w dodatkowym dodatku, dostępnym wraz z pełnym tekstem tego artykułu na stronie. W skrócie, próbki biopsji szpiku kostnego uzyskano od siedmiu osobników, z których wszyscy wyrazili pisemną świadomą zgodę na formę, która zawierała specyficzny język zezwalający na sekwencjonowanie całego genomu. Mieloblasty zostały wzbogacone za pomocą sortowania komórek. Biblioteki DNA sparowanego końca z próbek szpiku kostnego (dla wtórnej AML) i normalne próbki skóry zsekwencjonowano w analizatorze Illumina HiSeq 2000 i analizatorze genomu IIx. Wyrównane odczyty analizowano w celu wykrycia domniemanych mutacji somatycznych, jak opisano wcześniej.16 Przeprowadzono walidację mutacji somatycznych za pomocą wychwytywania w fazie stałej, a następnie przeprowadzono głębokie sekwencjonowanie skóry, zespół mielodysplastyczny i próbki AML wtórnego
[przypisy: dobry endokrynolog kielce, nefrolog, podolog ]
[podobne: flyboard allegro, zabiegi fizykalne, biomentin ]