Architektura klonalna wtórnej ostrej białaczki szpikowej AD 5

Nie mogliśmy zidentyfikować specyficznego dla sekwencji kontekstu dla tych przekrętów. Chociaż mutacje powodujące klonalny wzrost na każdym etapie nie są znane, klon tworzący w siedmiu próbkach zespołu mielodysplastycznego (zawierającego 182 do 660 mutacji) utrzymywał się we wszystkich siedmiu próbkach wtórnej AML i zawierał co najmniej jedną mutację poziomu 1. Klony założycielskie nabyły co najmniej jedną nową mutację poziomu z przewidywanymi konsekwencjami translacyjnymi podczas generowania klastrów specyficznych dla AML (ryc. 5 w dodatkowym dodatku). Geny o powtarzających się mutacjach wykryto zarówno w klonach założycielskich, jak i subklonach potomnych (rysunek 2B).
Dyskusja
Korzystając z sekwencjonowania nowej generacji, stwierdziliśmy, że odsetek nowotworowych komórek szpiku kostnego jest nie do odróżnienia w zespole mielodysplastycznym i wtórnej AML, co sugeruje, że zespoły mielodysplastyczne są tak samo klonalne jak wtórna AML, nawet z liczbą mieloblastów wynoszącą zero. Chociaż klonalność nie jest wystarczająca do zdefiniowania złośliwej transformacji, jest to kardynalna manifestacja większości ludzkich nowotworów, a nasze odkrycia sugerują, że zespoły mielodysplastyczne i wtórna AML są wysoce klonalnymi nowotworami hematologicznymi.31 Analiza udziału zmutowanych komórek w próbkach uzyskanych z ten sam osobnik przed i po progresji do wtórnej AML pozwolił nam porównać architekturę klonalną i zmutowane geny, aby uzyskać wgląd w genetykę tych chorób. Skuteczne wykrywanie klastrów mutacji było możliwe, ponieważ setki mutacji na genom zidentyfikowano przez sekwencjonowanie całego genomu, a obciążenia allelowe określono ilościowo przez głębokie ponowne sekwencjonowanie w dwóch punktach czasowych. Gdybyśmy przeanalizowali jedynie próbki wtórnej AML lub tylko warianty poziomu (tj. Egzomicznego), to złożoność nie mogła zostać wyjaśniona. W próbkach wszystkich siedmiu osobników genomy AML wtórnej były oligoklonalne. Istniejący klon mielodysplastycznego zespołu zawsze utrzymywał się w drugorzędowej AML, chociaż w niektórych przypadkach był niekompletny pod względem subklonów potomnych. Wraz z nabyciem każdego nowego zestawu mutacji, wszystkie istniejące wcześniej mutacje zostały przeniesione do przodu, co skutkowało subklonami, które zawierały rosnącą liczbę mutacji podczas ewolucji. Na podstawie naszego projektu eksperymentalnego nie można wykluczyć, że w próbkach mielodysplastycznego nie było dodatkowych subklonów, które nie były obecne w próbkach AML wtórnych, a jeden genom (UPN298273) sugeruje, że mogło to wystąpić.
Unikalnym aspektem biologii białaczki jest to, że komórki hematopoetyczne swobodnie mieszają się i recyrkulują między krwią obwodową a szpikiem kostnym. Klony, które utrzymują się i rosną w czasie, muszą zachować zdolność do samoodnowy. Mutacje w nowych klonach muszą zapewnić im przewagę wzrostu, aby skutecznie konkurować z klonami przodków. Powoduje to, że te drugorzędowe próbki AML nie są monoklonalne, ale zamiast tego są mozaiką kilku genomów z unikalnymi zestawami mutacji; ta mozaika jest kształtowana przez nabycie seryjnych mutacji i dywersyfikacji klonalnej. Podobnie niedawna analiza próbek AML de novo z wykorzystaniem sekwencjonowania całego genomu wykazała, że nawrót po chemioterapii jest związany z ewolucją klonalną i pozyskiwaniem nowych mutacji.32 Analiza poszczególnych komórek nowotworowych może ujawnić dodatkowe warstwy złożoności genetycznej. Niedawne badania ostrej białaczki limfoblastycznej z udziałem komórek B wykazały, że seryjne nabywanie nieprawidłowości cytogenetycznych w tej chorobie najczęściej odbywa się poprzez hierarchię rozgałęzień i tylko rzadko przebiega prostą ścieżką liniową.33,34 Rozszerzenie tej pracy w celu uwzględnienia pełnego zestawu odkrytych mutacji sekwencjonowanie całego genomu będzie głównym celem przyszłych badań nad genetyką raka.
Nasze badanie ma kilka implikacji klinicznych. Po pierwsze, rozróżnienie między zespołami mielodysplastycznymi a wtórną AML polega obecnie na ręcznym wyliczaniu mieloblastów szpiku kostnego, standardu, który podlega stronniczości, ale niemniej jednak pociąga za sobą ważne decyzje dotyczące leczenia pacjentów z niewielkimi różnicami w liczbie mieloblastów. Ostatecznie, identyfikacja wzorców patogennych mutacji i ich klonalność w próbkach szpiku kostnego od pacjentów z zespołami mielodysplastycznymi powinna prowadzić do większej pewności diagnostycznej i ulepszonych algorytmów prognostycznych. W tej notatce, dwóch pacjentów w naszym badaniu miało progresję od syndromów mielodysplastycznych do wtórnej AML w miesiącu. Ta progresja była oparta na wzroście liczby mieloblastów z 7% do 66% u jednego osobnika i od 13% do 43% u drugiego, pomimo braku zmiany liczby klonów (po dwa w każdym przypadku) i tylko nieznacznej wzrost mutacji punktowych (w tych przypadkach <2% uzyskano w trakcie progresji do wtórnej AML), gdy te same próbki analizowano za pomocą sekwen [więcej w: kardiolog dziecięcy, psychologia, Psycholog Wrocław ] [hasła pokrewne: przychodnia łomżyńska bydgoszcz rejestracja, olx inowroclaw, psychoterapia indywidualna kraków ]